Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDCP19113 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDCP19113 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDCP19113 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDCP19113 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDCP19113 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDCP19113 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDCP19113 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDCP19113 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDCP19113 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDCP19113 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDCP19113 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDCP19113 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDCP19113 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDCP19113 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDCP19113 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDCP19113 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDCP19113 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HDCP19113 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms