Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI3P10071 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI3P10071 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI3P10071 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI3P10071 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI3P10071 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI3P10071 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI3P10071 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI3P10071 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI3P10071 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI3P10071 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI3P10071 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI3P10071 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI3P10071 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI3P10071 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI3P10071 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI3P10071 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI3P10071 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI3P10071 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI3P10071 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI3P10071 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI3P10071 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI3P10071 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI3P10071 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI3P10071 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI3P10071 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI3P10071 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI3P10071 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms