Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms