Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTAGE9A4FU28 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms