Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms