Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RAB18Q9NP72 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms