Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms