Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLVAPQ9BX97 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms