Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms