Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms