Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD1Q8NBU5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD1Q8NBU5 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms