Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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LNX2Q8N448 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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LNX2Q8N448 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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