Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ATG4DQ86TL0 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ATG4DQ86TL0 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ATG4DQ86TL0 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ATG4DQ86TL0 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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