Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms