Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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