Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NANOGP8Q6NSW7 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms