Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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CCDC96Q2M329 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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CCDC96Q2M329 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CCDC96Q2M329 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CCDC96Q2M329 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CCDC96Q2M329 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CCDC96Q2M329 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CCDC96Q2M329 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CCDC96Q2M329 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CCDC96Q2M329 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CCDC96Q2M329 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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