Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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CCDC142Q17RM4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CCDC142Q17RM4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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