Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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