Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms