Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms