Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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