Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TCIRG1Q13488 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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