Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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