Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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