Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms