Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms