Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms