Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms