Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms