Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC3P51654 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC3P51654 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms