Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms