Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLMP48507 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms