Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFNP31947 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFNP31947 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms