Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms