Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPREP23469 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPREP23469 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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