Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms