Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRFP10586 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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