Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms