Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SCN2BO60939 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SCN2BO60939 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SCN2BO60939 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SCN2BO60939 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SCN2BO60939 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SCN2BO60939 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SCN2BO60939 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SCN2BO60939 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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