Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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HOXA2O43364 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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HOXA2O43364 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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HOXA2O43364 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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