Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms