Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms