Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HECTD4Q9Y4D8 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms