Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms