Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB4Q9UDY4 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms