Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms