Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC116348.1-201ENST00000562525 528 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ABCC6P1-202ENST00000565118 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 MIR345-201ENST00000362114 98 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms