Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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