Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-210ENST00000399606 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-212ENST00000399621 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-215ENST00000399637 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-216ENST00000399638 6595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-221ENST00000402845 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms